东莞理工学院1992年成立时开设电子技术与微机应用专业（专科）；1993年开设计算机应用专业（专科）；2000年成立计算机科学与技术系；2002年设置本科专业——计算机科学与技术（学校首批本科专业）；2003年设置本科专业——软件工程；2004年联合高等数学教研室和计算中心成立软件学院，是广东省首批示范性软件学院之一。2006年通过了首批学士学位授予专业评审，2008年更名为计算机学院，同年增设了本科专业——信息与计算科学。2016年、2017年分别增设网络工程、物联网工程专业。2016年改名为计算机与网络安全学院。2018年改名为计算机科学与技术学院，下设计算机科学与技术专业、物联网工程专业、数据科学与大数据技术专业和信息与计算科学专业，拥有计算机科学与技术一级学科硕士点；计算机科学与技术专业进入省一流专业建设点。
学院目前设有计算机科学与技术系、公共教学部和计算机科学与技术实验教学中心，包括软件开发课程组、计算数学课程组、系统与网络课程组、大数据与人工智能课程组、公共计算机课程组、高等数学课程组和工程数学课程组等七个课程组。在校本科生1100余人。
学院师资力量雄厚，现有教职工108人，其中教授16人，副教授36人，具有博士学位53人，IEEE Fellow 1人，享受国务院特殊津贴专家1人，“千百十人才工程”国家级培养对象1人、省级培养对象2人。
学院学科建设成果卓越，计算机应用技术为广东省重点特色学科；根据艾瑞深中国校友会网发布，2019年计算机科学与技术学科在全国排名53位，位次排名前18%，是我校在全国位次排名最高的学科。
学院拥有省级工程技术中心4个，广东高校科技创新团队、东莞市科技创新团队各1个，东莞市重点实验室3个。学院承担了大量国家、省、市科研项目，到账科研经费超过1亿元，以第一单位获得广东省科技进步二等奖1项、东莞市科技进步一等奖4项。
学院拥有完善的实验设备和优越的实验环境，是计算机科学与技术广东省实验教学示范中心。
学院坚持开门办专业，因材施教，致力培养学生工程能力、创新能力和就业竞争力，以校企深度合作为特色，与华为技术有限公司合作建有华为信息与网络技术学院。通过合作共建实验室、引入华为培训和课程体系创新人才培养模式，提升服务支撑产业能力。截至2018年10月，东莞理工学院华为信息与网络技术学院师资培训和学生考证通过率位列全球第一。