甘肃农业大学水利水电工程学院前身是创建于1974的农村水利电力专业，1999年更名为水利水电工程系，2003年与机电工程系合并组建工学院，2017年成立水利水电工程学院。学院现有在读全日制本科生、研究生1232人。        
学院现设水利水电工程、农业水利工程、水文与水资源工程、土木工程、测绘工程5个本科招生专业，其中水利水电工程专业和农业水利工程专业为第一批次录取本科专业。现有农业工程一级学科博士点1个，北方旱区作物生产装备工程二级交叉学科博士点1个；农业工程、水利工程省级重点学科2个；水利工程一级学科硕士点1个；农业水土工程、北方旱区作物生产装备工程二级学科硕士点2个；农业工程领域工程硕士点1个，农业机械化领域水利方向农业硕士点1个。   

学院拥有农业工程省级实验教学示范中心、甘肃省节水农业工程技术研究中心，并在校内外建有多个实践教学与研究基地、教学实习基地和产学研结合基地。与国内外科研院所、高等院校有广泛联系与合作，参与《1+2+1中美人才培养计划》项目。2010年6月，在甘肃农业大学探索本科生“3+1”培养模式的基础上，设有“3+1”人才培养模式的“大禹班”，设立了甘肃大禹节水集团股份有限公司研究生实践基地。    
学院近年来先后主持和参与国家重点研发计划项目课题、农业部行业专项、国家自然科学基金、甘肃省科技重大专项等科研项目50余项；获省级教学成果奖5项、省部级科研成果奖13项，其中省部级科技进步二等奖2项，三等奖10项；获国家发明专利6项、实用新型专利50余项；在国内外学术期刊发表论文500余篇，其中SCI、EI、ISTP收录30余篇，出版教材17部；学术专著8部，校级精品课程4门。
学院现有教职工59人，其中教授8人，博士生导师1人，副教授13人，硕士生导师8人。享受国务院政府特殊津贴1人，入选国家百千万工程国家级人选1人，甘肃省领军人才第一层次人选1人，甘肃省 “555”创新人才工程第二层次人选2人，甘肃省“飞天学者”特聘教授1人，教育部高等学校农业工程类专业教学指导委员会委员1人，甘肃省高等学校青年教师成才奖获得者1人；教师结构合理，多名教师先后到国外及国内一流大学研修、访学和学术交流。