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2015年学校官网显示，学院有4个一级学科硕士点、28个二级学科硕士点，3个硕士专业学位授权点，2009年，药学被列为云南省博士点立项建设学科；有7个省级重点学科。
一级学科硕士点：民族学、基础医学、临床医学、药学
硕士专业学位授权点：临床医学、药学、教育学
省级重点学科：药理学、病原生物学、药物化学、基础医学、药学、公共卫生与预防医学、生物学
教学建设
2015年5月学校官网显示，学校有2个国家级特色专业建设点、3个省级重点建设专业；2个省级实验教学示范中心；5门省级精品课程。
国家级特色专业建设点：护理学、药学
省级重点建设专业：临床医学、 护理学、药学
省级精品课程：教育学、药理学、医学微生物学及免疫学、内科学、人体生理学
省级实验教学示范中心：药学与化学实验中心、临床技能实训中心
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